Erikoistutkija tai tutkijatohtori multi-omiikkadatan analyysiin

Etsimme  motivoitunutta tutkijaa liittymään monitieteiseen systeemilääketieteen tutkimusympäristöön Turun yliopistossa. Tehtävä sijoittuu kansainvälisesti arvostettuun tutkimusryhmään, joka toimii multi-omiikan, metabolomiikan ja eksposomiikan sekä tekoälypohjaisen dataintegraation eturintamassa terveyden ja sairauksien tutkimuksessa.

Tehtävä on osa EU:n rahoittamaa INITIALISE-hanketta, jota koordinoidaan Turun yliopistossa. INITIALISE kokoaa yhteen Euroopan johtavat tutkimuspartnerit selvittämään immuunijärjestelmän kehityksen varhaisia elämänvaiheisiin liittyviä tekijöitä laaja-alaisten, pitkittäisten multi-omiikkatutkimusten avulla. Tutkimuksessa integroidaan aineistoja useista syntymäkohorteista ja kokeellisista malleista.

Tutkimuksemme keskittyy laajamittaisten molekyylitason aineistojen – mukaan lukien metabolomiikka, lipidomiikka, genomiikka, proteomiikka, glykomiikka ja mikrobiomitutkimus – yhdistämiseen kehittyneiden laskennallisten menetelmien kanssa. Tavoitteena on tunnistaa monimutkaisten sairauksien taustalla olevia mekanismeja sekä kehittää ennustavia, kliinisesti hyödynnettäviä malleja. Valittu henkilö työskentelee vahvasti yhteistyöhön perustuvassa ympäristössä, jossa on tiiviit yhteydet kliinisiin kohortteihin, kansainvälisiin konsortioihin ja Turku Bioscience Centren huippu-infrastruktuureihin.

Tehtävä tarjoaa ainutlaatuisen mahdollisuuden osallistua huipputason tutkimukseen systeemibiologian, tekoälyn ja translationaalisen lääketieteen rajapinnassa, poikkeuksellisten aineistojen parissa ja erinomaisilla julkaisumahdollisuuksilla.

Keskeiset tehtävät ja vastuualueet

• Soveltaa kehittyneitä tilastollisia ja koneoppimismenetelmiä korkeadimensionaalisten multi-omiikka-aineistojen analysointiin, mukaan lukien eksposomiikka, genomiikka, shotgun-metagenomiikka, glykomiikka, proteomiikka ja metabolomiikka ihmisen terveyden ja sairauksien kontekstissa.
• Osallistua monimutkaisten, pitkittäisten ja monimuotoisten aineistojen integrointiin ja tulkintaan.
• Dokumentoida analyyseja ja tukea tieteellistä raportointia, mukaan lukien käsikirjoitukset, raportit ja hankkeen raportointivelvoitteet.

Valintaperusteet määräytyvät Turun yliopiston johtosääntöjen ja ohjeiden mukaisesti. Tohtorin tutkinto ja vahva osaaminen on välttämätöntä. Rekrytoinnissa pyritään valitsemaan tehtävään pätevin ja sopivin henkilö. Koulutuksen, tieteellisten julkaisujen ja työkokemuksen lisäksi arvioinnissa huomioidaan henkilökohtaiset ominaisuudet, motivaatio, kielitaito sekä muu tehtävän kannalta relevantti osaaminen.

Vaadittavat pätevyydet

• Tohtorin tutkinto laskennallisessa tilastotieteessä, bioinformatiikassa, systeemibiologiassa tai läheisesti liittyvällä alalla.
• Vahva osaaminen tilastollisissa menetelmissä, mukaan lukien koneoppimismenetelmät, korkeadimensionaalisen omiikkadatan analysointiin, mieluiten myös pitkittäisaineistojen osalta.
• Erinomainen R-ohjelmointitaito.
• Näyttöä bioinformatiikan ja/tai multi-omiikkadatan analyysin alalta.
• Kyky työskennellä itsenäisesti, oma-aloitteisesti ja motivoituneesti.
• Erinomainen suullinen ja kirjallinen englannin kielen taito.

Eduksi katsotaan

• Vahva julkaisuhistoria tehtävään liittyvillä aloilla kansainvälisissä vertaisarvioiduissa tieteellisissä julkaisuissa.
• Osaaminen muissa ohjelmointikielissä (esim. Python, MATLAB tai Java).
• Kokemusta tilastollisten ja laskennallisten menetelmien soveltamisesta biolääketieteellisessä tutkimuksessa.
• Kokemusta hankeraportoinnista ja osallistumisesta yhteistyöhön perustuviin tutkimushankkeisiin.